民國71年8月1日，本校奉准獨立設校，正式為台北縣立深坑國民中學，省政府調派石門國中校長陸竹松先生為首任校長，於8月28日正式就職。

民國73年8月奉准附設國民中學補習學校，招收深坑、石碇、平溪等三鄉失學民眾，以解決就學問題，並提昇國民教育水準。

民國78年8月1日，原任校長陸竹松先生屆齡奉准退休，省政府派何金針女士為本校第2任校長，並於9月1日接篆視事。

民國79年8月1日，奉令成立啟智班，使身心障礙者，獲得更好照顧及學習，以達有教無類，因材施教的目標。

民國81年8月1日，校長何金針女士屆滿榮調，省政府派新竹縣立尖石國中校長李懿道女士為本校第3任校長，並於8月26日接篆視事。

民國83年8月1日，校長李懿道女士屆滿榮調，省政府派新竹縣立華山國中校長吳松溪先生為本校第4任校長，並於8月28日接篆視事。

民國84年8月奉淮附設技藝教育中心，提供本校及石碇、平溪等國中，有職業傾向學生，協助其發揮潛能，習得一技之長，立足社會，開拓一片美好天空。

民國85年8月1日，吳校長松溪屆滿榮調，省政府派林蕙質女士為本校第5任校長，並於8月23日接篆視事。

民國88年8月1日，林校長蕙質屆滿榮調，臺北縣政府遴聘平溪國中校長鄭秋榮先生為本校第6任校長。鄭校長任職後大力提倡多元智能之教學，推展小班教學的精神不遺餘力，加強生活教育，期五育均衡發展。

民國89年8月奉縣府令設置幼稚園1班。

民國92年8月1日，鄭校長秋榮屆滿榮調，臺北縣政府遴聘台北縣竹圍國中宋宏明先生為本校第7任校長。宋校長任職後秉持「尊重、關懷」的人本精神，推動「愛與榜樣」的品格教育，發展「社區有教室」的學校本位課程及永續校園改造工程，同時增進深坑國中、小的互動，以期成就一個有尊嚴、有自信且能自我實現的社會人。

民國96年8月1日，宋校長宏明屆滿榮調，臺北縣政府遴聘臺北縣漳和國中羅珮瑜女士為本校第8任校長。

民國98年，全校總班級數因連續6年增班而達到27班(普通班25班，特教班1班，幼稚園1班)，為創校以來之最！（92學年度總班級數16班，93學年度17班，94學年度19班，95學年度21班，96學年度23班，97學年度26班，98與99學年度均為27班）

民國100年1月1日，臺北縣改制為新北市，本校亦更名為新北市立深坑國民中學。

民國101年8月1日，羅校長珮瑜屆滿榮調，新北市政府遴聘本校王如杏女士為本校第9任校長。

民國103年8月10日，王校長如杏因故請假，新北市政府遴聘本市中山國中陳春男先生為本校代理校長。

民國104年8月1日，新北市政府遴聘陳春男先生為本校第10任校長。

民國109年8月1日，陳校長春男屆滿榮調，新北市政府遴聘平溪國中校長李建英女士為本校第11任校長。

本校校地面積共24,739平方公尺，目前總班級數為15班（含特教班1班），教職員工約60位，學生約300位。教師平日本諸『忠、信、篤、敬』傳統校訓，以「尊重、關懷」的人本精神，培養學生「卓越、多元」的健全人格，孕育社會良好國民。